Alternative Symbols
- COL12A1L [HGNC]
Alternative Names
- collagen, type XII, alpha 1 [HGNC]
- collagen, type XII, alpha 1-like [HGNC]
SNPs
| rsID | SNPedia | dbSNP | Chips | Special Name | Wild (plus) | Risk (plus) | Frequency | PubMed IDs |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| rs970547 |  | | A45 | CC | TT | C=0.253039 | 23013106 22894972 | |
| rs6453815 | | A45 | AA | GG | A=0.278144 | |||
| rs556674 | | A45 | GG | AA | G=0.234614 | |||
| rs240736 | | A45 | AA | GG | G=0.263974 | |||
| rs240734 | | A45 | AA | A=0.368135 | ||||
| rs2300795 | | A45 | AA | GG | G=0.123344 | |||
| rs12215389 | | A45 | AA | GG | G=0.142138 | |||
| rs117983152 | | A45 | CC | TT | T=0.018508 | |||
| rs9343271 | | A5 | TT | CC | C=0.031242 | |||
| rs79830915 | | A5 | CC | TT | T=0.005094 | |||
| rs77654847 | | A5 | AA | CC | C=0.000922 | |||
| rs77425231 | | A5 | CC | TT | T=0.007585 | |||
| rs77094372 | | A5 | CC | TT | T=0.002614 | |||
| rs72891676 | | A5 | GG | TT | T=0.018006 | |||
| rs72878527 | | A5 | GG | AA | A=0.024576 | |||
| rs6916551 | | A5 | CC | TT | T=0.035097 | |||
| rs619607 | | A5 | CC | TT | T=0.054875 | |||
| rs51630 | | A5 | TT | CC | T=0.248256 | |||
| rs41266761 | | A5 | CC | TT | T=0.004070 | |||
| rs34369939 | | A5 | GG | G=0.007335 | ||||
| rs240741 | | A5 | TT | CC | C=0.150835 | |||
| rs2295252 | | A5 | TT | CC | C=0.039252 | |||
| rs2273264 | | A5 | GG | G=0.029108 | ||||
| rs201567848 | | A5 | GG | TT | T=0.000897 | |||
| rs201408175 | | A5 | TT | T=0.000406 | ||||
| rs201372309 | | A5 | GG | AA | A=0.000044 | |||
| rs201158030 | | A5 | AA | A=0.000080 | ||||
| rs200828190 | | A5 | TT | GG | G=0.000106 | |||
| rs200487396 | | | A5 | GG | AA | A=0.000124 | ||
| rs199724285 | | A5 | GG | AA | A=0.000115 | |||
| rs190917891 | | A5 | TT | T=0.000067 | ||||
| rs189842215 | | A5 | GG | AA | A=0.007199 | |||
| rs189762594 | | A5 | CC | C=0.000597 | ||||
| rs186836845 | | A5 | CC | GG | G=0.000012 | |||
| rs186328815 | | A5 | TT | T=0.000056 | ||||
| rs182759307 | | A5 | AA | GG | G=0.001171 | |||
| rs180718181 | | A5 | AA | GG | G=0.000088 | |||
| rs17186509 | | A5 | TT | CC | C=0.179934 | |||
| rs16886183 | | A5 | CC | TT | T=0.025962 | |||
| rs148810173 | | A5 | GG | AA | A=0.000196 | |||
| rs147044263 | | A5 | CC | TT | T=0.000134 | |||
| rs141593495 | | A5 | AA | A=0.000765 | ||||
| rs140583215 | | A5 | AA | A=0.000016 | ||||
| rs139332405 | | A5 | CC | TT | T=0.002264 | |||
| rs1332019 | | A5 | AA | A=0.211798 | ||||
| rs116980451 | | A5 | TT | AA | A=0.000245 | |||
| rs796052093 | | | A | AA | GG | |||
| rs34438461 | | A | TT | T=0.000671 | ||||
| rs200315815 | | A | AA | A=0.001696 | ||||
| rs200197000 | | A | GG | TT | T=0.007299 | |||
| rs148065232 | | A | TT | T=0.000111 | ||||
| rs141517088 | | A | AA | A=0.002493 | ||||
| rs117038107 | | A | GG | AA | A=0.008680 | |||
| rs1131691933 | | A | GG | AA | ||||
| rs1131691587 | | A | GG | AA | ||||
| rs1064797326 | | | A | CC | TT | |||
| rs1064795770 | | | A | AA | GG | |||
| rs9447453 | | 4 | AA | A=0.090453 | ||||
| rs7758152 | | 4 | CC | TT | T=0.098074 | |||
| rs636885 | | 4 | GG | TT | G=0.120413 | |||
| rs4706592 | | 4 | TT | CC | C=0.251266 | |||
| rs3777510 | | 4 | TT | T=0.178238 | ||||
| rs3777505 | | 4 | AA | A=0.095239 | ||||
| rs240732 | | 4 | AA | GG | A=0.081573 | |||
| rs240731 | | 4 | TT | CC | T=0.379308 | |||
| rs240727 | | 4 | GG | G=0.126314 | ||||
| rs240724 | | 4 | GG | G=0.281815 | ||||
| rs240366 | | 4 | CC | C=0.124020 | ||||
| rs2300792 | | 4 | TT | CC | C=0.020706 | |||
| rs1332778 | | 4 | TT | CC | T=0.308797 | |||
| rs1332020 | | 4 | TT | T=0.431766 | ||||
| rs13201278 | | 4 | AA | A=0.055675 | ||||
| rs11966644 | | 4 | AA | CC | C=0.182085 | |||
| rs875989819 | | | CC | TT | T=0.000004 | |||
| rs796052094 | | | CC | TT |
PubMed References
-
PMID:23013106 [rs970547]
PMID:22894972 [rs970547]
PMID:9143499 [HGNC]
Other References
-
SNPedia=COL12A1
ClinVar=COL12A1
GeneCards=COL12A1
Wikipedia=COL12A1
Google=COL12A1